Bioinformatique : alignement de séquences et arbre phylogénétique TraAM 2014- Académie de Versailles- Sébastien CHAZALON et Gilles ROSSI

, par Géraldine Carayol

Ce traAM, travail académique mutualisé, se présente sous la forme de 2 activités utilisant le numérique ;

  • Alignement de séquences, dans le cadre de l’étude d’un ADN de la "bête du Gévaudan" : utilisation de BLAST
  • Arbre phylogénétique : utilisation de ClustalW
Téléchargez le fichier pdf du TraAM sur les alignements de séquence
TraAM Bioinformatique : alignement de séquences- Sébastien CHAZALON et Gilles ROSSI
Documents complémentaires (Annexes 1 et 2)
Annexe 1 : Alignement de séquences
Annexe 2 : Blast, ClustalW et NCBI
Corrigé de ce TraAM

L’exercice préliminaire peut être fait en ligne :
<jeu1>

L’activité propose l’utilisation de sites couramment utilisés en recherche

Compétences B2i développées :
• Domaine1 : s’approprier un espace numérique de travail.
• Domaine 3 : produire, traiter, exploiter et diffuser des documents numériques
• Domaine 4 : organiser la recherche d’informations

Pour en savoir plus :

Sur l’univers du loup garou et de la bête du Gévaudan : lisez "l’homme à l’envers", de Fred Vargas
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