Bioinformatique : alignement de séquences et arbre phylogénétique
TraAM 2014- Académie de Versailles- Sébastien CHAZALON et Gilles ROSSI
Mis à jour le samedi 19 juillet 2025 , par
Ce traAM, travail académique mutualisé, se présente sous la forme de 2 activités utilisant le numérique ;
– Alignement de séquences, dans le cadre de l’étude d’un ADN de la "bête du Gévaudan" : utilisation de BLAST
– Arbre phylogénétique : utilisation de ClustalW
| Téléchargez le fichier pdf du TraAM sur les alignements de séquence | ||
| Documents complémentaires (Annexes 1 et 2) | ||
| Corrigé de ce TraAM | ||
L’exercice préliminaire peut être fait en ligne :
<jeu1>
L’activité propose l’utilisation de sites couramment utilisés en recherche
– Blast
– NCBI
– ClustalW
Compétences B2i développées :
• Domaine1 : s’approprier un espace numérique de travail.
• Domaine 3 : produire, traiter, exploiter et diffuser des documents numériques
• Domaine 4 : organiser la recherche d’informations
| Pour en savoir plus :
– sur l’analyse de séquences d’ADN – sur Blast – sur NCBI Voir également le site Bioinformatique du lycée de la vallée de Chevreuse |
| Sur l’univers du loup garou et de la bête du Gévaudan : lisez "l’homme à l’envers", de Fred Vargas |
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